Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gtf3c6Q9D8P7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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