Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cldn23Q9D7D7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn23Q9D7D7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn23Q9D7D7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn23Q9D7D7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn23Q9D7D7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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