Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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