Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cmtm5Q9D6G9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cmtm5Q9D6G9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cmtm5Q9D6G9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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