Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc9bQ9D6E4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms