Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgms2Q9D4B1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms