Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms