Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Fndc8Q9D2H8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fndc8Q9D2H8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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