Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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