Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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