Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms