Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms