Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9CRC3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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