Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ifitm3Q9CQW9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ifitm3Q9CQW9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ifitm3Q9CQW9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ifitm3Q9CQW9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ifitm3Q9CQW9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ifitm3Q9CQW9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ifitm3Q9CQW9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ifitm3Q9CQW9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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