Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms