Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf2Q9CQJ4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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