Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Higd2aQ9CQJ1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Higd2aQ9CQJ1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Higd2aQ9CQJ1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Higd2aQ9CQJ1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Higd2aQ9CQJ1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Higd2aQ9CQJ1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms