Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl11Q9CQF0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl11Q9CQF0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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