Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms