Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nsmce3Q9CPR8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms