Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms