Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sf3b1Q99NB9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b1Q99NB9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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