Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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