Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms