Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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