Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms