Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms