Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Emc3Q99KI3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms