Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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