Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec3Q99J72 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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