Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Rnf144aQ925F3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf144aQ925F3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf144aQ925F3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf144aQ925F3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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