Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms