Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps3Q91VB4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms