Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpcsQ8VDG5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms