Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubxn4Q8VCH8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubxn4Q8VCH8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubxn4Q8VCH8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubxn4Q8VCH8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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