Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Vmn1r200Q8R281 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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