Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hecw1Q8K4P8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms