Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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