Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vrk3Q8K3G5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vrk3Q8K3G5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms