Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lrrtm1Q8K377 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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