Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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