Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pms1Q8K119 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pms1Q8K119 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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