Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms