Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Hpf1Q8CFE2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Hpf1Q8CFE2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Hpf1Q8CFE2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Hpf1Q8CFE2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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