Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ercc8Q8CFD5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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