Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf170Q8CBG9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms