Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc113Q8C5T8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc113Q8C5T8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms