Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc30Q8BVF4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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