Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdcl3Q8BVF2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pdcl3Q8BVF2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pdcl3Q8BVF2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pdcl3Q8BVF2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pdcl3Q8BVF2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms