Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zfp398Q8BV16 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp398Q8BV16 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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